Коллектив лаборатории, созданной в 2015 г., ведёт активные исследования по двум направлениям: (1) перенос и накопление частиц микропластика в морской среде и (2) роль промежуточных слоёв в термохалинном конвейере Балтийского моря. Совместное использование экспедиционных измерений, мониторинговых наблюдений, данных дистанционного зондирования и реанализа, применение методов лабораторного эксперимента и численного моделирования позволяют коллективу проводить исследования на мировом уровне. Это подтверждается многочисленными публикациями в высокорейтинговых журналах, изданием монографии и участием коллектива в международных проектах.

Лаборатория образовалась в 1962 г., когда в Калининград приехали молодые геологи Инна Павловна Свиренко, Анатолий Васильевич Солдатов и Борис Александрович Кошелев. В апреле 1963 г. зту группу возглавил Емельян Михайлович Емельянов. В 1967 г. группа преобразована в лабораторию геологии Атлантики под руководством Е.М. Емельянова.

В 2024-2025 гг. лаборатория работает по общей для АО ИО РАН теме госзадания № FMWE-2024-0025 "Эволюция ключевых природных комплексов Атлантического океана и Балтийского моря: современное состояние и палеореконструкции", руководитель темы – В.В. Сивков.

В 2024-2025 гг. лаборатория работает по общей для АО ИО РАН теме госзадания №FMWE-2024-0025 "Эволюция ключевых природных комплексов Атлантического океана и Балтийского моря: современное состояние и палеореконструкции", руководитель темы – В.В. Сивков) и теме № FMWE-2021-0007 "Морские и океанские экосистемы в условиях меняющегося климата и антропогенного воздействия: структура и биологическая продуктивность экосистемы Арктического бассейна и морей России, экосистемы и потенциальные биологические ресурсы открытого океана" (руководитель темы д.б.н. Флинт М.В.).