Часть исследований Атлантического отделения проводятся совместно с другими отечественными и зарубежными организациями. Исследования на Балтике выполнялись при участии ВСЕГЕИ, а также ЦНИИ им. акад. Крылова и ЦНИИ "Гранит", Института микробиологии им. Виноградского РАН и др.
Атлантическое отделение ИОРАН поддерживает теснейшие связи с Музеем Мирового океана, с Балтийским федеральным университетом им.И.Канта (БФУ им. И.Канта)(ранее РГУ им.И.Канта), с Калининградским государственным техническим университетом (КГТУ), АтлантНИРО, а также с другими научными и учебными заведениями.
Соглашения и договора о сотрудничестве между АО ИО РАН и зарубежными и отечественными организациями и научными учебными заведениями:
-
NRA (USA) (04.06.1998 – 30.09.1998)
-
РФФИ (27.05.1998 -31.12.1998)
-
Morski Instytut Rybacki (MIR) (г. Гдыня) (15.12.1998 – бессрочный)
-
Институт географии (Литва) (21.12.1998 - бессрочный)
-
Institute for Mechanic of Technical University Darmstadt (MTUD, Дармштадт) (24.02.1999 - 31.12.2005)
-
ИО РАН (15.03.1999 - 31.12.1999)
-
РФФИ (01.04.1999 - 01.04.2000)
-
ГГМ РАН (01.11.1999 – 31.12.2001)
-
Балтийский институт экологии гидросферы (БИЭГ, Калининград) (01.11.1999 -15.12.1999) закончен
-
Институт экологии и Институт исследования Балтийского моря Ростокского университета (Германия) / Institute of Biological Sciences – Faculty of Mathematics and Natural Sciences University of Rostock (22.12.1999 г.)
-
Морской гидрофизический институт Национальной Академии Украины (МГИ НАНУ, Севастополь) (10.11.2000 г. бессрочный)
-
Institute for Baltic Research (IOW, Варнемюнде, Германия) (19.12.2000 г. – 2001г. закончен)
-
Institute for Mechanic of Technical University Darmstadt (MTUD, Дармштадт) (20.08.2001 - 15.12.2002)
-
Государственный Геологический Институт Польши, Отделение морской геологии (Гданьск) / Polish Geological Institute - National Research Institute, Branch of Marine Geology (PGI BMG) (Gdansk) (27.08.2001 г.)
-
МАМГ (Канада) (26.11.2001 - 27.04.2002)
-
Национальный секретариат российской стороны Еврорегиона «Балтика» (Балтийск) (20.02.2002 г.)
-
Калининградский центр по гидрометеорологии и мониторингу окружающей среды (КЦГМС) (05.06.2002 г. бессрочный)
-
Музей мирового океана (Калининград) (01.07.2002 - 01.07.2005) закончен
-
Областное Государственное унитарное предприятие (ОГУП) «Балтберегозащита» (28.04.2003 г. бессрочный)
-
Институт геологии и географии АН Литвы (Вильнюс) / Geologjos ir Geografijos Institutas (Institute of Geology and Geography, Vilnius, Lithuania) (08.09.2003 г. бессрочный)
-
Областное Государственное унитарное предприятие (ОГУП) «Балтберегозащита» (01.03.2006 г. бессрочный)
-
Гданьский университет / Gdansk University ( 2007 г. бессрочный)
-
Калининградская Ассоциация Энергосбережения (КАЭ) (11.01.2008 г. бессрочный)
-
МГУ им. М.В.Ломоносова, Геологический факультет (Москва) (2008 - 2012)
-
Вильнюсский университет, Факультет Естественных наук / Vilnius University, Faculty of Natural Sciences, Lithuania (12.04.2008 г. бессрочный)
-
Институт морской рыбацкий в Гдыне / Sea Fisheries Institute in Gdynia (Morski Instytut Rybacki (MIR)) (продлён 25.05.2009 - 25.05.2013)
-
Балтийский федеральный университет им.И.Канта (БФУ, ранее РГУ им.И.Канта) Факультет географии и геоэкологии (заключён 01.07.2009 г. бессрочный)
-
Балтийский федеральный университет им.И.Канта (БФУ, ранее РГУ им.И.Канта) (с ЛМЭ заключён 30.07.2009 - 31.08.2014)
-
Институт водного строительства Польской Академии наук / Institute of Hydro-engineering of the Polish Academy of Sciences (IBW PAN, Гданьск) (продлён 02.03.2010 - 02.03.2014)
-
Геологическая служба Литвы при министерстве Окружающей среды (Вильнюс) (04.03.2010 г. бессрочный)
-
Морской Институт в Гданьске / Maritime Institute in Gdansk (MIG) (продлён 11.03.2010 -31.12.2015)
-
Институт метеорологии и водного менеджмента (IMGW, Варшава) / Instytut Meteorologii i Gospodarki Wodnej /IMGW/ (заключён 12.03.2010 г. бессрочный) закончен
-
Институт планирования и береговых исследований Клайпедского университета / Coastal Research & Planing Institute, Klaipeda University (KU CORPI) (продлён 02.04. 2010 г. бессрочный)
-
МГУ им. М.В.Ломоносова, Географический факультет (Москва) (22.06.2010 - 31.12.2015)
-
Geo Mission Limited (Лондон) (01.07.2010 – 30.06.2012) закончен
-
Одесский государственный экологический университет Министерства образования и науки Украины (ОГЭКУ, Одесса)) (05.07.2010 - 31.12.2015)
-
Российский государственный гидрометеорологический университет (РГГМУ, СПб) (07.07.2010 - 2015)
-
Открытое акционерное общество «Научно-производственный комплекс «Научно-исследовательский институт дальней радиосвязи»» (ОАО «НПК «НИИДАР» (Москва) (23.08.2010 г. бессрочный)
-
Институт метеорологии и водного менеджмента (IMGW, Варшава) / Instytut Meteorologii i Gospodarki Wodnej /IMGW/ (20.09.2010 - 31.03.2011) закончен
-
Институт метеорологии и водного менеджмента (IMGW, Варшава) / Instytut Meteorologii i Gospodarki Wodnej /IMGW/ (продлён 23.09.2010 - 15.11.2010) закончен
-
Институт экологии и Институт исследования Балтийского моря Ростокского университета (Германия) / Institute of Biological Sciences – Faculty of Mathematics and Natural Sciences University of Rostock (продлён 08.12.2010 - 08.12.2015)
-
Институт пресноводного рыболовства им. С.Саковича г.Ольштын (Польша) / Instytut Rybactwa Srodladowego im. St.Sakowicza w Olsztynie (Polska) (16.02.2011 - 16.02.2016)
-
Федеральное государственное унитарное предприятие «Атлантический научно-исследовательский институт рыбного хозяйства и океанографии» (АтлантНИРО) (15.03.2011 г. бессрочный)
-
Региональная общественная организация «Калининградская областная федерация парусного спорта» (05.04.2011 - 05.04.2014)
-
Общество с ограниченной ответственностью «Экологический мониторинг, менеджмент, аудит и консалтинг» (ЭкоММаК) (11.04.2011 - 31.12.2011) закончен
-
Институт проблем механики РАН (Учреждение Российской академии наук Институт проблем механики им. А.Ю.Ишлинского РАН) (заключён 01.06.2011 г.)
-
Общество с ограниченной ответственностью «Экологический мониторинг, менеджмент, аудит и консалтинг» (ЭкоММаК) (10.01.2012 - 10.01.2017 )
-
ФГБУП «Всероссийский научно-исследовательский геологический институт им. А.П. Карпинского (ФГБУП «ВСЕГЕИ») (25.01.2012 - 25.01.2017)
-
ФГБУ «Национальный парк «Куршская коса» (24.02.2012 г.)
-
Институт биологии внутренних вод им. И.Д. Папанина (пос. Борок) (04.04.2012 -04.04.2017)
-
Государственный Геологический Музей им. В.И.Вернадского РАН (20.09.2012 - 20.09.2017)
-
Институт вычислительного моделирования Сибирского отделения РАН (г. Красноярск) (01.10.2012 - 01.10.2017)
-
Музей Мирового океана (ММО) (Калининград) (01.10.2012 - 01.10.2017)
-
Научно-исследовательский институт прикладной информатики и математической геофизики Балтийского федерального университета имени Иммануила Канта (НИИ ПИ и МГ БФУ им. И.Канта) (15.01.2013 - 15.01.2016
-
Институт озероведения Российской академии наук (ИНОЗ РАН) (30.12.2012 г. – 30.12.2017 г.)
-
ФГАОУ ВПО «БФУ им. И.Канта» (г. Калининград) (04.04.2013 - 04.04.2018; 01.07.2013 - 30.06.2018)
-
ФГБОУ ВПО «Санкт-Петербургский государственный аграрный университет» (ФГБОУ ВПО СПбГАУ) (13.05.2013 - 13.05.2018)
-
Центр геоэлектромагнитных исследований Института физики Земли им. О.Ю. Шмидта РАН (ЦГЭМИ ИФЗ РАН) (г. Троицк) (01.10.2013 - 01.10.2018)
-
Западное отделение Института земного магнетизма (ЗО ИЗМИ РАН) (г. Калининград) (15.10.2013 - 15.10.2018)
-
ФГБОУ ВПО «Калининградский государственный технический университет» (КГТУ) (г. Калининград) (01.11.2013 - 01.11.2018)