В 2021-2023 гг. лаборатория работает по общей для АО ИО РАН теме госзадания № FMWE-2021-0012 "Морские природные системы Балтийского моря и Атлантического океана: формирование природных комплексов Балтийского моря и их изменение под влиянием Атлантического океана и антропогенного воздействия" (руководитель темы к.г.-м.н. Сивков В.В.) и теме № FMWE-2021-0007 "Морские и океанские экосистемы в условиях меняющегося климата и антропогенного воздействия: структура и биологическая продуктивность экосистемы Арктического бассейна и морей России, экосистемы и потенциальные биологические ресурсы открытого океана" (руководитель темы д.б.н. Флинт М.В.).